Atol est un gestionnaire de fichiers à double panneaux, ce qui permet d'ouvrir deux dossiers différents et de copier/coller des fichiers de l'un à l'autre très facilement.

Il supporte la création de marques pages et permet la gestion des archives compressées à partir de plugins (zip, tar, gz, bz2, arj, rar, lst). Il est multi plateformes et intègre également un client FTP et SFTP (sous Windows uniquement).

Des couleurs personnalisées peuvent être appliquées pour repérer visuellement d'un coup d'oeil des fichiers avec une extension spécifique.